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Azure Sapphire™NIR-Q使多重Western blotting標(biāo)準(zhǔn)化變得輕而易舉
現(xiàn)代數(shù)字檢測儀器對于western blotting不僅僅是檢測“有或沒有”的技術(shù),還可以進行western blotting重復(fù)性和定量的檢測。在檢測方法的線性動態(tài)范圍,對數(shù)據(jù)進行標(biāo)準(zhǔn)化以控制蛋白上樣量和膜轉(zhuǎn)印帶來的變化,可以獲得真正的定量結(jié)果。 但是,對蛋白印跡進行標(biāo)準(zhǔn)化的**方法是什么? 過去,金標(biāo)準(zhǔn)標(biāo)準(zhǔn)化方法是使用看家蛋白,基于這些蛋白在不同實驗條件下和細胞系中表達一致的假設(shè)。 然而,*近的研究表明,這種假設(shè)并不總是正確的,導(dǎo)致相對蛋白豐度的測量結(jié)果不準(zhǔn)確。 相反,定量Western blotting專家和他們發(fā)表的期刊正在推薦一種新的金標(biāo)準(zhǔn)用于標(biāo)準(zhǔn)化,總蛋白定量 - 通過在膜上染色,檢測每個泳道的總蛋白進行標(biāo)準(zhǔn)化分析。
Azure Biosystems™的Sapphire™NIR-Q多功能激光生物分子成像系統(tǒng)具有兩個用于近紅外熒光檢測(700nm和800nm)的通道和用于檢測總蛋白專用的第三通道,使多重Western blotting標(biāo)準(zhǔn)化變得輕而易舉。
您可以繼續(xù)使用相同的NIR染料,同時加入總蛋白質(zhì)染色劑,例如我們的低背景和易于使用的AzureRed試劑。 無需剝離和重孵育能夠檢測兩種不同的蛋白和總蛋白信號。
> 定量更準(zhǔn)確
> 檢測更靈活
> 平臺設(shè)計更靈活
> 模塊化設(shè)計
使用看家蛋白進行標(biāo)準(zhǔn)化
使用看家蛋白**缺點是在樣品間和不同條件下表達水平可能不一致。如使用看家蛋白進行標(biāo)準(zhǔn)化,必須先花費時間和精力來驗證蛋白的選擇,并且可能需要檢查多種潛在的標(biāo)準(zhǔn)品,然后才能找到一種在所有樣品中真正表達同一水平,并且在不同實驗條件下不會發(fā)生變化的標(biāo)準(zhǔn)品。
使用看家蛋白的第二個重大挑戰(zhàn)是它們的表達豐度很高,如果樣品中的看家蛋白表達非常高,這會限制在凝膠上加載的樣品量,因為需要保留看家蛋白在線性檢測范圍內(nèi)并且不會使看家蛋白的信號飽和。 如果感興趣的蛋白不是同樣高度表達,這兩種蛋白質(zhì)不在同一線性檢測范圍內(nèi)。
如果您正在進行多重蛋白印跡,例如比較同一蛋白質(zhì)的磷酸化和非磷酸化形式,則需要考慮的第三個挑戰(zhàn)是從不同物種中產(chǎn)生一抗和二抗的復(fù)雜性。
*后,檢測的看家蛋白可能干擾感興趣蛋白的檢測。理想情況下,看家蛋白應(yīng)該與感興趣蛋白的大小不同,因此這兩種蛋白可在印跡上空間分辨。 當(dāng)實驗在同一印跡上檢查多種目的蛋白時,這變得越來越困難。
圖1.與常見的看家蛋白相比,AzureRed具有更寬的線性動態(tài)范圍
單色通道圖像A)AzureRed染色總蛋白B)Tubulin C)β-action和D)GAPDH。 AzureRed信號的優(yōu)異動態(tài)范圍
與實際加載的蛋白量顯示在圖像(A)中。使用AzureSpot軟件定量來自總蛋白和看家蛋白的信號,并將得到的值
相對于每個樣品加載的蛋白量(E)作圖。與常見的看家蛋白相比,AzureRed表現(xiàn)出更強的相關(guān)性和更廣泛的動態(tài)范圍。
使用總蛋白進行標(biāo)準(zhǔn)化 使用總蛋白標(biāo)準(zhǔn)化,不是試圖找到可以代表轉(zhuǎn)移到膜上的樣品總量的蛋白,而是直接在膜上測量總蛋白,并且該值在標(biāo)準(zhǔn)化時用作分母。許多總蛋白染色劑可用于染色凝膠和膜。總蛋白染色提供更寬的動態(tài)范圍,并且表現(xiàn)出比看家蛋白更低的可變性和更清楚的數(shù)據(jù)。 總蛋白標(biāo)準(zhǔn)化比使用看家蛋白質(zhì)快得多,特別是對于化學(xué)發(fā)光印跡,因為相對于剝離和重孵育染色步驟花費較少的時間。 理想情況下,在免疫檢測之前或之后,在膜上進行總蛋白染色。使用一些染色劑如AzureRed Fluorescent Total Protein Stain,可以在免疫檢測前對印跡進行染色,然后與目的蛋白同時對總蛋白進行成像。 通過這種*簡單的工作流程,目的蛋白和總蛋白的圖像會自動對齊。 與使用看家蛋白相比,圖像捕獲后的分析工作流程基本不變;整個泳道或泳道中大部分信號用于標(biāo)準(zhǔn)化,而不是單一的條帶。 用總蛋白染色劑對膜進行染色提供了額外的質(zhì)控優(yōu)勢,可以驗證轉(zhuǎn)印是否完全。 使用AzureRed進行的總蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)化很容易適合任何蛋白質(zhì)印跡工作流程